Naším posláním je provádět základní a translační biomedicínský výzkum s cílem lépe porozumět příčinám infekčních a nádorových onemocnění člověka a vyvíjet budoucí humánní léčivé přípravky, zdravotnické prostředky a diagnostika. Naší vizí je podporovat partnerství veřejného a soukromého sektoru a výzkumnou spolupráci a začleňovat naše výzkumné pracovníky do mezinárodních platforem. Usilujeme o další posilování postavení IMTM jako předního vzdělávacího centra, které poskytuje kvalitní vzdělávání v oblasti biomedicínských věd v bakalářském, magisterském a doktorském studiu. K dosažení těchto cílů IMTM soustřeďuje a udržuje „pod jednou střechou“ dva typy infrastruktur pro základní a translační biomedicínský výzkum:
- Vysoce kvalitní materiální zázemí, například nejmodernější zobrazovací pracoviště, technologie pro vysokokapacitní screening a omické technologie, vysoce kvalitní zvěřince, klinická centra, biobanku atd.
- Vědecký a vysoce profesionální tým projektového řízení, který vede projekty translačního výzkumu a zajišťuje vzdělávání a odbornou přípravu studentů, mladých vědeckých pracovníků a výzkumně orientovaných klinických lékařů.