Workshop 9ADD (26.–30. ledna 2026) je mezinárodní hybridní akce pořádaná Univerzitou Palackého v Olomouci, která se zaměřuje na moderní přístupy in silico v návrhu léčiv. Kombinuje přednášky a praktické tutoriály v oblasti návrhu léčiv založeného na struktuře i na ligandech, včetně molekulového dokování, molekulové dynamiky, farmakoforů, QSAR, návrhu de novo a hlubokého učení, a vedou jej přední odborníci z akademické sféry i průmyslu.
Workshop je zaměřen na využití nástrojů a přístupů in silico v návrhu léčiv. Pokrývá jak návrh léčiv založený na struktuře (molekulové dokování, molekulová dynamika, nástroje strukturní bioinformatiky), tak návrh léčiv založený na ligandech (QSAR, farmakofory, hluboké učení), a to formou přednášek i praktických tutoriálů.
Kromě vzdělávacího programu zahrnuje workshop také exkurzi na pracoviště IMTM a soutěžní výzvu, v níž účastníci – jednotlivě nebo v týmech – využijí výpočetní metody k prioritizaci sloučenin proti skutečnému biologickému cíli ze slepého datového souboru s cílem v omezeném čase odhalit co nejvíce skutečně aktivních hitů. Nejúspěšnější predikce budou seřazeny v žebříčku, oceněny cenami a zváženy pro prospektivní nákup sloučenin a experimentální validaci, čímž se výpočetní modelování přímo propojí s reálnými výsledky vývoje léčiv.
Více informací o workshopu najdete ZDE.
Setkání proběhne hybridní formou. Přednášky a soubory k tutoriálům budou k dispozici online, praktické tutoriály však budou probíhat pouze na místě.
Workshop 9ADD je součástí programu EATRIS Spotlight.
PROGRAM
Pondělí
- Zahájení (Karel Berka)
- Úvod do návrhu léčiv (Karel Berka)
- Structure Alphafoldology (Karel Berka)
- Chemoinformatické nástroje PBD-Cat a Activity Cliffs (Aleix Gimeno Vives)
- Přednáška RowanSci – snadný online přístup k nástrojům molekulového modelování (Corin Wagen)
- Rychlá představení posterů
- Posterová sekce – sborník abstraktů
Úterý
- Reakční informatika (Alexandre Varnek)
- Chemoinformatika (Johannes Kirchmair)
- Kvantová mechanika v návrhu léčiv (Martin Lepšík)
- Analýza substruktur ve vývoji léčiv (Peter Ertl)
tutoriály:
- Farmakofory (Thierry Langer)
- Tutoriál k farmakoforům (Thierry Langer) + instalace LigandScout (licenční kód obdrží účastníci registrovaní na místě přímo na workshopu)
souběžně s:
- Online platforma a nástroje RowanSci (Jonathon Vandezande)
- Strukturní analýza pomocí online nástrojů – PrankWeb, MOLE, Vina (Marian Novotný, Anna Špačková)
Středa
- Přednáška o molekulovém dokování (Federica Moraca)
- Úvod do kofoldingu + aplikace (Semen Yesylevskyy)
- Využití návrhu léčiv při vývoji přípravků na ochranu rostlin (Hanoch Senderowitz)
Tutoriály:
- Tutoriál k molekulovému dokování (Federica Moraca)
- Molekulová dynamika s OpenMMDL (Niklas Piet Doering, Dr. Valerij Talagayev)
souběžně s:
- EasyDock (Pavel Polishchuk) + ZIP soubor k tutoriálu Easydock (Pavel Polishchuk)
- StreaMD (Aleksandra Ivanova, Pavel Polishchuk)
Čtvrtek
- QSAR (Wim Dehaen)
- Úvod do návrhu de novo (Martin Šícho)
tutoriály:
- Tutoriál k vizualizaci chemického prostoru (Martin Šícho)
- Tutoriál QSAR v Pythonu (Wim Dehaen)
- Návrh de novo pomocí CReM (Dr. Pavel Polishchuk, Guzel Minibaeva)
souběžně s:
- Nástroje Orange pro automatizaci pipeline (Dr. Marko Jukic, Dr. Crtomir Podlipnik)
- Tutoriál QSAR s online platformou OCHEM (Dr. Igor Tetko)
- Návrh de novo pomocí DrugEx (Dr. Martin Sicho)
Pátek
- Prospektivní výběr léčiv (Pavel Polishchuk)
