Přejít k hlavnímu obsahu

Klíčové pracoviště chemické biologie a vysokokapacitního screeningu

O nás

Klíčové pracoviště vysokokapacitního screeningu (HTS) IMTM představuje jednu z největších a nejmodernějších robotických screeningových platforem v akademickém prostředí. Naším cílem je urychlit objevování a vývoj nových potenciálních nízkomolekulárních léčiv a identifikovat a charakterizovat nové terapeutické a biologické cíle. Máme více než desetileté zkušenosti s prováděním rozsáhlých screeningových kampaní na plně automatizované a flexibilní robotické platformě (HighResBiosolutions Ltd.) Náš kvalifikovaný a zkušený tým má odborné znalosti v oblasti manipulace s kapalinami, robotické automatizace, různých detekčních technologií a analýzy velkých dat a je připraven vám pomoci a spolupracovat s vámi na naplnění požadavků vašeho projektu.

 

Naše dovednosti: 

  • Screeningové testy ve formátu 384- nebo 1536jamkových destiček
  • Biochemické testy (např. interakce protein – protein a protein – nukleová kyselina, testy inhibice enzymů, testy vazby receptor – ligand)
  • Buněčné  testy (např. testy buněčné proliferace, testy s reportérovými geny pro mapování nejvýznamnějších signálních drah a receptorů)
  • Typy buněk: imortalizované buněčné linie (nenádorové i nádorové), primární buňky, kmenové buňky, senescentní buňky, 3D buněčné kultury)
  • Různé detekční metody (např. absorbance, luminiscence, fluorescence, fluorescenční polarizace)
  • Vysokoobsahová analýza (např. fenotypové testy, cell painting, analýza buněčného cyklu, aktivita poškození a opravy DNA, integrita cytoskeletu, kolokalizační studie)
  • Knihovny sloučenin:
    IMTM: Komerční knihovna sloučenin (více než 3.000 sloučenin se známou aktivitou)
    IMTM: Vlastní knihovna (více než 15.000 unikátních malých molekul)
    IMTM: Knihovna DrugLike (soubor 100.000 malých molekul s vlastnostmi podobnými léčivům)

 

Pracovní postup HTS screeningu 

 

Napojení na výzkumné infrastruktury
Služby
Vývoj testů

Cílem je převést váš laboratorní test na spolehlivou, robustní a reprodukovatelnou metodu vhodnou pro platformu HTS. Tento zásadní krok umožňuje snížit náklady na reagencie a zvýšit kapacitu. Zaměřujeme se na miniaturizaci (převod testu ze zkumavek či formátu 96jamkové destičky do formátu 384jamkové nebo 1536jamkové destičky), optimalizaci (koncentrace složek, stabilita reagencií, tolerance k DMSO, doba inkubace, pozitivní a negativní kontroly,…), automatizaci a validaci vašeho testu. 

Primární screening

Primární screeningové kampaně jsou běžně prováděny jako jednobodové testy. Hodnotí se pouze jedna definovaná koncentrace sloučeniny/molekuly (10 µM) vůči testovanému cíli ve třech replikátech na různých destičkách. Na základě stanoveného prahu se vybírají aktivní molekuly.

Sekundární screening

V sekundárním screeningu (testování křivky závislosti odpovědi na dávce) se sloučenina testuje v rozsahu koncentrací (7 bodů, ředicí faktor 4) za účelem stanovení koncentrace vyvolávající poloviční maximální odpověď (hodnota IC50, resp. EC50). 

Identifikace hitů

Data z primárního a/nebo sekundárního screeningu se ukládají a analyzují v různých systémech (např. software Dotmatics, Columbus Image Data Storage and Analysis System). Hlavním úkolem našeho týmu je vybrat skutečné hity, tedy nejslibnější kandidáty. Pro úspěšný výběr hitů provádíme další testy, jako jsou ortogonální testy, counter-screening, testy selektivity a cytotoxicity. 

Testy zavedené na platformě HTS IMTM
  • Kolorimetrický test MTS
  • Luminiscenční test viability buněk založený na ATP
  • Cytotoxická aktivita specifická pro CYP2W1
  • Test inhibice karboanhydráz
  • Test vazby na adenosinové receptory
  • Test CaFlux
  • Test aktivity C-Myc
  • Analýza buněčného cyklu v živých buňkách s indikátorem FUCCI
  • Test Cell Painting
  • Test translokační aktivity hAR a hGR
  • Měření mitochondriálního potenciálu pomocí barvení TMRM
  • Test polymerace tubulinu in vitro 
  • Aktivátory/inhibitory dráhy Sonic Hedgehog sledováním lokalizace Smo v ciliích 
  • Translokace z cytoplazmy do jádra, např. NPL4
  • Inhibitory agregace proteinu tau
  • Inhibitory agregace alfa-synukleinu
Naše vybavení a přístrojové zázemí
PerkinElmer Operetta imaging system
Zarezervovat tento přistroj
PerkinElmer EnVision HTS Multilabel Plate Reader
Zarezervovat tento přistroj
PerkinElmer microplates reader ViewLux uHTS Microplate Imager
Zarezervovat tento přistroj
Formulář žádosti o službu
Do tohoto pole může být nahráno neomezené množství souborů.
Limit 256 MB.
Povolené typy: gif jpg jpeg png bmp eps tif pict psd txt rtf html odf pdf doc docx ppt pptx xls xlsx xml avi mov mp3 mp4 ogg wav bz2 dmg gz jar rar sit svg tar zip.
Beru na vědomí, že odesláním výše uvedeného formuláře pro podání návrhu projektu souhlasím s tím, že EATRIS-CZ, zastoupená národním uzlem, Ústavem molekulární a translační medicíny (IMTM), Lékařská fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci, bude zpracovávat mé osobní údaje výhradně za účelem odpovědi na návrh projektu a souvisejících informací uvedených ve formuláři.
Beru na vědomí, že výše uvedené informace a údaje nemají důvěrnou povahu a EATRIS-CZ je může zpracovávat pro účely interního hodnocení projektu a navazování partnerství.
CAPTCHA
Vložte znaky zobrazené na obrázku.
This question is for testing whether or not you are a human visitor and to prevent automated spam submissions.
Kontakty

Máte-li jakékoli dotazy nebo byste chtěli prodiskutovat potřeby svého genomického výzkumu, neváhejte nás kontaktovat. Náš vstřícný a zkušený tým je vám připraven pomoci. Kontaktovat nás můžete následujícími způsoby:

 

  • Telefon: +420 585 632 069
  • E-mail: hts.imtm@imtm.cz
  • Adresa: Ústav molekulární a translační medicíny, Lékařská fakulta a Český institut výzkumu a pokročilých technologií, Univerzita Palackého v Olomouci, Hněvotínská 5, 779 00 Olomouc, Česká republika

 

Těšíme se, že se staneme součástí vašeho genomického výzkumu, a na spolupráci na průlomových objevech, které budou utvářet budoucnost vědy a medicíny. Pojďme společně odhalit potenciál genomiky!