EATRIS Plus – stěžejní projekt v oblasti personalizované medicíny
Náš stěžejní projekt EATRIS Plus si klade za cíl vybudovat další kapacity a poskytnout inovativní vědecké nástroje na podporu strategie dlouhodobé udržitelnosti EATRIS jako jedné z klíčových evropských výzkumných infrastruktur pro personalizovanou medicínu.
Hlavní cíle projektu EATRIS-Plus:
konsolidovat kapacity EATRIS v oblasti personalizované medicíny (zejména omických technologií) tak, aby lépe sloužily akademické sféře i průmyslu, a rozšířit počet inovačních center EATRIS (EATRIS Innovation Hubs) s velkými farmaceutickými společnostmi;
posilovat postavení pacientů prostřednictvím jejich aktivního zapojení do činnosti infrastruktury;
rozšířit strategická partnerství s výzkumnými infrastrukturami a dalšími relevantními aktéry a
dále posílit dlouhodobou udržitelnost finančního modelu EATRIS.
Konsorcium EATRIS Plus
Konsorcium tvoří 19 partnerů, mezi něž patří všechny současné národní uzly výzkumné infrastruktury, akademičtí zástupci nových potenciálních členských zemí a také zastřešující organizace zastupující hlas pacientů a biotechnologické společnosti.
EATRIS-ERIC, Nizozemsko
Univerzita Palackého v Olomouci, Česko
Madrid Health Service, Španělsko
University of Helsinki, Finsko
Luxembourg Institute of Health/Integrated Biobank Of Luxembourg, Lucembursko
Radboud University Medical Centre, Nizozemsko
University of Ljubljana, Slovinsko
Trinity College Dublin, Irsko
Riga Stradins University, Lotyšsko
Uppsala University, Švédsko
Technical University of Munich, Německo
European Patients’ Forum, Lucembursko
Vall D’Hebron Research Institute, Španělsko
CEA-NeurATRIS, Francie
Italian National Institute of Health, Itálie
University Of Oslo, Norsko
BIOCAT, Španělsko
INFARMED, Portugalsko
Sofia University, Bulharsko
Pracovní balíčky
WP1 – Multiomické technologie pro personalizovanou medicínu
WP2 – Správa dat a integrace omického výzkumu v personalizované medicíně
WP3 – Hodnocení kvality omických technologií
WP4 – Plánování dlouhodobé udržitelnosti
WP5 – Zapojení zainteresovaných stran
WP6 – Spolupráce s průmyslem a modely otevřených inovací
WP7 – Vzdělávání
WP8 – Mezinárodní spolupráce
WP9 – Koordinace a řízení
WP10 – Etické požadavky
Pozadí a vědecké zdůvodnění – proč to děláme?
Efektivní rozvoj personalizované medicíny závisí na dostupnosti validovaných biomarkerů zaměřených na pacienta. Přestože naše schopnost identifikovat genetické varianty spojené s komplexními onemocněními roste, tyto varianty plně nevysvětlují výsledné fenotypy onemocnění, a je proto zapotřebí přesnější porozumění molekulárním profilům.
Toto poznání je důvodem pro vývoj multiomických přístupů. Aby se příslib multiomiky stal skutečností, je nutné překonat systémová úzká místa, která ovlivňují oblast biomarkerů:
- nízká úroveň technologické a analytické harmonizace;
- nedostatečná správa dat a nedodržování principů FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable – vyhledatelná, dostupná, interoperabilní a opakovaně použitelná data);
- nedostatečné porozumění vztahu mezi genomickými biomarkery a navazujícími molekulárními markery (mimo jiné transkriptomickými, proteomickými a metabolomickými);
- chybějící spolehlivé kontrolní referenční hodnoty těchto biomarkerů ve zdravé populaci;
- a nedostatečné porozumění klinickým potřebám, které vede k omezenému zavádění do klinické praxe.
Systematické řešení těchto problémů je jedním z našich hlavních cílů. Konsorcium usiluje o vytvoření multiomické sady nástrojů na podporu meziomických analýz a integrace dat v klinických vzorcích. Tato sada nástrojů bude obsahovat:
- konsenzuální standardní operační postupy (SOP) pro omické technologie;
- doporučené postupy pro omické analytické procesy;
- validované referenční materiály pro analytické procesy;
- parametry kvality pro srovnávací hodnocení kvality;
- nástroje pro analýzu dat a jejich převod do souladu s principy FAIR;
- kritéria pro stanovení referenčních hodnot v populačních kohortách;
- postupy pro řešení problémů;
- přístup k úložišti multiomických referenčních hodnot
Omické nástroje budou vyvinuty a otestovány na demonstrátoru v reálném prostředí – již zavedené kohortě 1 000 zdravých jedinců v Česku, u nichž již bylo provedeno genomové sekvenování. Informace o této kohortě zdravých jedinců budou během projektu rozšířeny o transkriptomická, proteomická a metabolomická data.
Poskytnutím takové sady nástrojů výzkumné komunitě se EATRIS-Plus stane hnacím motorem kvalitního výzkumu v oblasti stratifikace pacientů a urychlí zavádění řešení personalizované medicíny. EATRIS je evropská infrastruktura pro translační medicínu, která poskytuje služby urychlující biomedicínské inovace.
Tento projekt získal finanční podporu z programu Evropské unie pro výzkum a inovace Horizon 2020 na základě grantové dohody č. 871096
Akronym projektu: EATRIS Plus
Program financování: Horizon 2020
Rozpočet: 4 900 000 EUR
Koordinátor: EATRIS